Som just nämndes nyttjas Clomid huvudsakligen till att behandla infertila kvinnor genom att öka chanserna för en lyckad befruktning. Dock kan det även användas till andra syften. Det har även använts (med viss framgång) för att behandla infertilitet hos män.

​

Det är även ett uppskattat medikament hos en del bodybuilders. En del använder det nämligen som ett PCT (Post Cycle Therapy) eftersom det minskar mängden östrogen samtidigt som det höjer mängden testosteron i kroppen.